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病害无疑是这两年罗非鱼养殖所遇到的最大问题，四川农业大学动物医学院院长汪开毓教授指出，罗非鱼已经不再是一条怎么养都不会死的鱼，如何才能养殖成功，避开病害是罗非鱼养殖户们最为关注的事情。
汪开毓指出，水温高、溶解氧低、密度高、投饲量大容易引起罗非鱼应激、抵抗力低，是诱发链球菌病的主要因素。常规药物治疗包括使用抗生素：土霉素、强力霉素、氟苯尼考、阿莫西林等，而寻找敏感性更强的药物以及疫苗的研发将是未来的重要研究方向。
但他同时也提出，现在罗非鱼只要一发病就容易被认为是链球菌病，诊断有误的话可能导致治疗用药不准，不但达不到预期效果，还延误了治疗时机。“在罗非鱼诊断时要注意‘多因一症’的现象，如眼球的充血、白浊和凸出等被认为是链球菌病症，也有可能是由于虹彩病毒病、假单胞菌病、爱德华氏菌病、营养素缺乏等原因引起。”
广州精博生物科技科有限公司王玉群结合了相关产品讲述了链球菌病全套的防治方案，而在回答养殖户关于为何针对性药物治疗效果也不强时，王玉群认为，首先可能药量不够，因为发病后投喂饲料量往往会下降，而用药是按照投喂饲料来定，饲料不足时，往往被健康鱼或是套养鱼抢食，病鱼由于活动能力弱反而没吃到药饵；其次，用药时间可能不够；另外蓝藻，氨氮、亚硝酸盐高影响药效；此外消毒不彻底可能也会导致药效不能有效发挥。
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